庁連携で案件を新規作成しようとしましたが、未登録発明者マスタの出願人が不明もしくは現在存在しない会社です。

発明者登録画面では、「発明者」マスタの登録が必要となり、
発明者マスタには所属する「出願人」マスタを設定する必要があります。

未登録発明者マスタの出願人が不明もしくは現在存在しない会社である場合は、
案件作成画面では暫定的に発明者の所属する出願人を選択し、
案件作成後に発明者マスタを編集し紐づく出願人を変更します。

出願人が不明の場合は、「出願人不明」や「所属なし」という出願人マスタを作成し、
それに紐づけするのも運用の一案です。